Olink NextSeq 2000 Déan iniúchadh ar Seicheamh

Nóta doiciméad
Tá lámhleabhar Úsáideora Olink® Explore, doc nr 1153, imithe as feidhm, agus tá na doiciméid seo a leanas curtha ina ionad:

• Olink® Déan Iniúchadh Tharview Lámhleabhar úsáideora, doc 1187
• Lámhleabhar Úsáideora Olink® Explore 384, doc 1188
• Lámhleabhar Úsáideora Olink® Explore 4 x 384, doc 1189
• Lámhleabhar Úsáideora Olink® Explore 1536 & Leathnú, doc nr 1190
• Lámhleabhar Úsáideora Olink® Explore 3072, doc 1191
• Olink® Explore Seicheamhú ag úsáid Lámhleabhar Úsáideora NextSeq 550, doc nr 1192
• Olink® Explore Seicheamhú ag úsáid Lámhleabhar Úsáideora NextSeq 2000, doc nr 1193
• Seicheamhú Olink® Explore ag úsáid Lámhleabhar Úsáideora NovaSeq 6000, doc nr 1194

Réamhrá

Úsáid atá beartaithe
Is ardán imdhíonta ilphléacs é Olink® Explore chun bithmharcóir próitéine daonna a fhionnachtain. Tá an táirge beartaithe le haghaidh Úsáide Taighde Amháin, agus ní le húsáid i nósanna imeachta diagnóiseacha. Ní bheidh an obair saotharlainne á rith ach ag foireann oilte saotharlainne. Ní dhéanfaidh ach foireann oilte sonraí a phróiseáil. Tá sé i gceist na torthaí a úsáid ag taighdeoirí i gcomhar le torthaí cliniciúla nó saotharlainne eile.
Maidir leis an lámhleabhar seo
Soláthraíonn an Lámhleabhar Úsáideora seo na treoracha a theastaíonn chun Olink® Explore Libraries a chur in ord ar Illumina® NextSeq™ 2000. Ní mór na treoracha a leanúint go docht agus go sainráite. D'fhéadfadh sonraí lagaithe a bheith mar thoradh ar aon diallais ar fud na gcéimeanna saotharlainne. Sula dtosaíonn tú ar an sreabhadh oibre saotharlainne, téigh i gcomhairle leis an Olink® Explore Overview Lámhleabhar Úsáideora le haghaidh réamhrá ar an ardán, lena n-áirítear faisnéis faoi imoibrithe, trealamh agus doiciméadú atá ag teastáil, os a chionnview den sreabhadh oibre, chomh maith le treoirlínte saotharlainne. Le treoracha a fháil maidir le conas Feisteáin Imoibrí Olink® Explore a rith, féach ar an Lámhleabhar Úsáideora Olink® Explore is infheidhme. Le haghaidh próiseála sonraí agus anailís ar thorthaí seicheamh Olink® Explore, féach ar Lámhleabhar Úsáideora Olink® NPX Explore. Is le Olink® Proteomics AB gach trádmharc agus cóipcheart atá san ábhar seo, mura luaitear a mhalairt.
Tacaíocht theicniúil
Le haghaidh tacaíocht theicniúil, déan teagmháil le Olink Proteomics ag tacaíocht@olink.com.

Treoracha saotharlainne

Soláthraíonn an chaibidil seo treoracha maidir le conas Leabharlanna Olink a chur in ord ar NextSeq™ 2000 ag baint úsáide as Imoibrithe NextSeq™ 1000/2000 P2 (100 Timthriall) v3. Is é an prótacal a úsáidtear le haghaidh seicheamhú ná oiriúnú ar shreabhadh oibre caighdeánach NGS Illumina® le haghaidh Illumina® NextSeq™ 2000.
Sula dtéann tú ar aghaidh chuig seicheamhú, cinntigh go bhfuil cáilíocht Leabharlann Olink íonaithe fíoraithe. Déan tagairt don Lámhleabhar Úsáideora Olink Explore is infheidhme le haghaidh treoracha faoi rialú cáilíochta.
Déan an rith seicheamhaithe a phleanáil
Is féidir Leabharlann Olink amháin a chur in ord in aghaidh na cille sreafa NextSeq™ 2000 P2 agus in aghaidh an rith. Déantar cur síos i dTábla 2 ar líon na gceall sreafa P1 agus na ritheanna a theastaíonn chun na Feisteáin Imoibrí Olink Explore éagsúla a sheicheamhú.
Má tá níos mó ná rith amháin ag teastáil, déan na treoracha a bhfuil cur síos orthu sa lámhleabhar seo arís.
Tábla 1. Pleanáil rith seicheamhaithe

Olink® Explore Imoibrí Kit	Líon Leabharlanna Olink	Líon na gcill sreafa(cha) agus na rith(eanna)
Olink® Déan iniúchadh ar 384 Kit Imoibrí	1	1
Olink® Déan iniúchadh ar threalamh imoibrí 4 x 384	4	4
Olink® Déan iniúchadh ar 1536 Kit Imoibrí	4	4
Olink® Déan iniúchadh ar threalamh imoibrí leathnaithe	4	4
Olink® Déan iniúchadh ar 3072 Kit Imoibrí	8	8

Ullmhaigh Olink® oideas Saincheaptha
Le linn na céime seo, ullmhaítear an t-oideas saincheaptha Olink® ar an NextSeq™ 2000. Ní gá an chéim seo a dhéanamh ach uair amháin, sula ndéantar rith seicheamhaithe Olink don chéad uair.
Dízip agus sábháil an t-oideas saincheaptha Olink XML-file Olink_NSQ2K_P2_V1 i bhfillteán uirlisí cuí.
NÓTA: Ní oibreoidh an t-oideas saincheaptha Olink ach leis an trealamh NextSeq™ 1000/2000 P2 Imoibrithe (100 Timthriall) v3 agus na bogearraí rialaithe NextSeq™ 1000/2000 v1.2 nó v1.4.

Ullmhaigh imoibrithe seicheamhaithe
Le linn na céime seo, déantar an cartús imoibrí ina bhfuil imoibrithe braisle agus seicheamhaithe a leá agus ullmhaítear an chill sreafa.

RABHADH: Tá ceimiceáin a d'fhéadfadh a bheith guaiseach sa chartús imoibrí. Caith trealamh cosanta imleor agus caith amach imoibrithe a úsáidtear i gcomhréir leis na caighdeáin is infheidhme. Le haghaidh tuilleadh faisnéise, féach ar Threoir an Chórais Illumina NextSeq 1000 agus 2000 (doiciméad #1000000109376).

Ullmhaigh cartúis imoibrí
Is féidir an datha neamhoscailte a leá trí úsáid a bhaint as trí mhodhanna éagsúla: ag teocht an tseomra, i ndabhach uisce rialaithe, nó sa chuisneoir.

Binse a ullmhú

• Cartús Imoibrí 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 (100 timthriall)

Treoracha
Leáigh an cartús imoibrí mar a thuairiscítear i dTábla 2.
Tábla 2. Modhanna leá cartúis imoibrí

Modh leá	Treoracha
Ag teocht an tseomra	• Gan an mála scragall airgid a oscailt, cuir an datha imoibrí reoite ar an mbinse agus é a leá ag teocht an tseomra ar feadh 9 uair an chloig. Ná níos mó ná 16 uair an chloig. • Cinntigh go bhfuil aghaidh ar lipéad an mhála agus gur féidir leis an aer dul timpeall ar an gcartús.
I ndabhach uisce	• Gan an mála scragall airgid a oscailt, cuir an cartús imoibrí reoite leath-báite i ndabhach uisce rialaithe 25 °C agus lig dó leá ar feadh 6 huaire an chloig. Ná níos mó ná 8 uair an chloig. • Déan deimhin de go bhfuil aghaidh ar lipéad an mhála agus nach n-aistríonn an datha le linn leá. • Triomaigh an datha go maith le tuáille páipéir.
Sa chuisneoir	• Gan an mála scragall airgid a oscailt, cuir an datha ar an mbinse agus é a leá ag teocht an tseomra ar feadh 6 huaire. • Cinntigh go bhfuil aghaidh ar lipéad an mhála agus gur féidir leis an aer dul timpeall ar an gcartús. • Críochnaigh leá an datha sa chuisneoir ar feadh 12 uair an chloig. Ná níos mó ná 72 uair an chloig. • Roimh an rith, bain an datha neamhoscailte leáite as an gcuisneoir agus lig dó teocht an tseomra a bhaint amach ar feadh 15 nóiméad ar a laghad, ach gan níos mó ná 1 uair an chloig.

NÓTA: Ní féidir cartúis leáite a athreoite agus ní mór iad a stóráil ag 4 °C, ar feadh 72 uair an chloig ar a mhéad.

Ullmhaigh sreabhadhchill Ullmhaigh binse

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Sreabhadhchill

Treoracha

1. Tabhair an chill sreafa cuisnithe go teocht an tseomra ar feadh 10-15 nóiméad.

Ullmhaigh Leabharlann Olink® le haghaidh seicheamhú

Le linn na céime seo, caolaítear Leabharlann Olink íonaithe agus rialaithe cáilíochta go dtí an tiúchan luchtaithe deiridh. Tabhair faoi deara go ndéantar dínádúrú na Leabharlainne go huathoibríoch ar bord na hionstraime.
Binse a ullmhú

• Lib Tube, ullmhaithe de réir Lámhleabhar Úsáideora Olink Explore is infheidhme
• 1x RSB le Tween 20
• MilliQ uisce
• Feadáin mhicrealártheifneora 2x (1.5 mL)
• Pípéad láimhe (10, 100 agus 1000 μL)
• Scag leideanna pípéad

Sula dtosaíonn tú

• Leáigh an Tube Lib má tá sé reoite.
• Leáigh an RSB reoite le Tween 20 ag teocht an tseomra ar feadh 10 nóiméad. Stóráil ag +4 °C go dtí go n-úsáidfear é.
• Marcáil an dá fheadán nua micrealártheifneoir 1.5 mL mar seo a leanas:
  • Marcáil feadán amháin “Dil” (don Leabharlann caolaithe 1:100)
  • Marcáil feadán amháin “Seq” (don Leabharlann réidh le lódáil)

Treoracha

1. Cuir 495 μL d'uisce MilliQ leis an Feadán Dil.
2. Vortex an Lib Tube agus casadh síos go hachomair é.
3. Aistrigh 5 μL de láimh ón Lib Tube go dtí an Feadán Dil.
4. Vortex an Dil Tube agus casadh síos go hachomair é.
5. Cuir 20 μL de RBS le Tween 20 leis an Seq Tube.
6. Aistrigh 20 μL de láimh ón Dil Tube go dtí an Feadán Seq.
7. Vortex an Seq Tube agus casadh síos go hachomair é.
8. Lean ar aghaidh láithreach go dtí 2.5 Lódáil chill sreafa agus Leabharlann Olink® isteach i gcartán imoibrí. TABHAIR FAOI DEARA: Stóráil an Feadán(í) Lib ag -20 °C ar eagla go mbeadh athrith(í) ann.

Luchtaigh sreabhchill agus Leabharlann Olink® isteach i gcartús imoibrí
Le linn na céime seo, déantar an chill sreafa agus an Leabharlann Olink caolaithe a luchtú isteach sa datha imoibrí leáite.
Binse a ullmhú

• 1x Leáite NextSeq™ 1000/2000 P2 Cartús Imoibrí (100 timthriall), ullmhaithe sa chéim roimhe seo
• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Sreabhadh Cell, ullmhaithe sa chéim roimhe seo
• Feadán Gnéas (le Leabharlann Olink caolaithe réidh le luchtú), ullmhaithe sa chéim roimhe seo
• Pípéad láimhe (100 μL)
• Leid pípéad (1 mL)

Ullmhaigh an datha

1. Bain an datha as an mála scragall airgid.
2. Inbhéartaigh an datha deich n-uaire chun na himoibrithe leáite a mheascadh go críochnúil laistigh.

NÓTA: Is gnách comhpháirteanna inmheánacha a chloisteáil ag glioscarnach.

Luchtaigh an chill sreafa isteach sa cartúis

1. Nuair a bheidh tú réidh chun an chill sreafa a luchtú isteach sa datha, bain an chill sreafa as an bpacáiste. Coinnigh an chill sreafa in aice leis an gcluaisín liath, agus an lipéad ar an táb os comhair suas. Bain úsáid as lámhainní nua saor ó phúdar chun dromchla gloine na cille sreafa a éilliú a sheachaint.
2. Cuir an chill sreafa isteach sa sliotán cille sreafa ar thaobh tosaigh an datha. Léiríonn cliceáil inchloiste go bhfuil an chill sreafa suite i gceart.
3. Bain an cluaisín liath trína tharraingt amach.

Luchtaigh Leabharlann Olink® isteach sa datha

1. Pierce taiscumar na Leabharlainne le tip glan pípéad 1 ml.
2. Luchtaigh 20 μL de Leabharlann Olink ón Seq Tube go bun an taiscumar leabharlainne.

Déan rith seicheamhaithe Olink®
Le linn na céime seo, déantar an cartús Maolán leis an gcill sreafa luchtaithe agus Leabharlann Olink a luchtú isteach sa NextSeq™ 2000, agus cuirtear tús leis an rith seicheamhaithe ag baint úsáide as an t-oideas Olink.
Binse a ullmhú

• Cartús Imoibrí 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 (100 timthriall) luchtaithe leis an gCill Sreabhadh NextSeq ™ 1000/2000 P2 agus an Leabharlann Olink caolaithe, ullmhaithe sa chéim roimhe seo.

Cumraigh an Mód Rith

1. Ón roghchlár bogearraí rialaithe, roghnaigh Socruithe.
2. Faoi Seicheamh BaseSpace Mol Seirbhísí & Tacaíocht Réamhghníomhach, roghnaigh Socrú Rith Áitiúil.
3. Roghnaigh Tacaíocht Réamhghníomhach Amháin mar shocruithe breise. Éilíonn an fheidhm seo nasc idirlín.
4. Roghnaigh an Suíomh Óstáil do do shonraí. Ba cheart go mbeadh an Suíomh Óstála i do réigiún nó gar dó.
5. Socraigh suíomh an Fhillteáin Aschuir le haghaidh na sonraí amha reatha. Roghnaigh Roghnaigh le nascleanúint a dhéanamh agus roghnaigh an fillteán aschur.
6. Roghnaigh an ticbhosca Denature and Caolú Ar Bord chun an Leabharlann ar bord na hionstraime a dhínádúrú agus a chaolú go huathoibríoch.
7. Roghnaigh an ticbhosca Cartús Imoibrí Purge chun imoibrithe neamhúsáidte a ghlanadh go huathoibríoch chuig urrann imoibrithe caite an datha.
8. Roghnaigh an ticbhosca le haghaidh nuashonruithe bogearraí le seiceáil go huathoibríoch le haghaidh nuashonruithe bogearraí (roghnach). Éilíonn an fheidhm seo nasc idirlín.
9. Roghnaigh Sábháil.

Socraigh paraiméadair rith

NÓTA: Baineann an treoir seo le leagan 1.4 de bhogearraí rialaithe NextSeq™ 1000/2000. D’fhéadfadh roinnt de na céimeanna a thuairiscítear thíos a bheith difriúil nuair a bhíonn leagan v1.2 in úsáid

1. Ón roghchlár bogearraí rialaithe, roghnaigh Tosaigh.
2. Roghnaigh Socrú Nua Rith de Láimh agus brúigh Socrú.
3. Sa leathanach Socrú Rith, socraigh na paraiméadair rith mar seo a leanas:

• Sa réimse Ainm Rith, cuir isteach ID turgnaimh uathúil.
• Sa liosta anuas Léigh Cineál, roghnaigh an rogha Léigh Aonair.

Cuir isteach líon na dtimthriallta mar seo a leanas:

• • Léigh 1: 24
  • Innéacs 1: 0
  • Innéacs 2: 0
  • Léigh 2: 0

NÓTA: Tá sé ríthábhachtach go bhfuil Léigh 1 socraithe go 24, nó ní theipfidh ar an rith iomlán.
NÓTA: Déan neamhaird de na teachtaireachtaí rabhaidh agus tú ag dul isteach ar líon na dtimthriallta.

• Sa liosta anuas Custom Primer Wells, roghnaigh Uimh.
• Sa Oideas Saincheaptha (roghnach) réimse, roghnaigh Roghnaigh le nascleanúint a dhéanamh agus roghnaigh an t-oideas saincheaptha XML file Olink_NSQ2K_P2_V1. Roghnaigh Oscail.
• Ná iompórtáil Sample Bileog.
• Cinntigh go bhfuil suíomh an Fhillteáin Aschuir i gceart. Seachas sin, roghnaigh Roghnaigh le nascleanúint a dhéanamh agus roghnaigh an suíomh fillteán aschur atá ag teastáil.
• Sa réimse Denature and Caol Onboard, roghnaigh Cumasaithe ón liosta anuas.
• Roghnaigh Prep.

Íoslódáil an cartúis luchtaithe

1. Roghnaigh Luchtaigh. Osclaíonn scáthlán na hionstraime agus díbrítear an tráidire.
2. Cuir an datha luchtaithe ar an tráidire agus an lipéad os comhair aníos agus an tsreabhchill laistigh den uirlis.
3. Roghnaigh Dún.
4. Nuair a bheidh an datha luchtaithe i gceart, fíoraigh na paraiméadair rith agus roghnaigh Seicheamh. Déanann an uirlis seiceálacha réamhreáchtála ar an ionstraim agus ar na sreabháin.
   NÓTA: Le linn na seiceála sreabhánaic, táthar ag súil go gcloisfear roinnt fuaimeanna popping.
5. Cinntigh go dtosóidh an rith tar éis na seiceálacha uathoibríocha réamh-rith a bheith críochnaithe (~15 nóiméad). Is é an t-am a rith seicheamhaithe thart ar 10h30 min.
   NÓTA: Le haghaidh aon teipeanna seiceála réamh-rith, féach treoracha an mhonaróra.
   NÓTA: Bí cúramach gan bualadh isteach nó cur isteach ar shlí eile ar NextSeq™ 2000 le linn na seicheamhaithe. Tá an ionstraim íogair do chreathadh.
6. Glan an limistéar oibre.

Monatóireacht a dhéanamh ar Dul Chun Cinn Rith
Úsáideann Olink NGS mar léamh amach chun méid seichimh aitheanta a chainníochtú chun tiúchan próitéine tugtha i s a mheasamples (i gcoibhneas le s. eileamples). Déantar cáilíocht sonraí ó gach reáchtáil seicheamhaithe Explore a chinneadh go príomha ag paraiméadair QC atá uathúil do theicneolaíocht Olink. Mar sin, is lú an tábhacht atá leis na méadrachtaí caighdeánacha um rialú cáilíochta a úsáidtear i ngnáthscór NGS, mar shampla Q-scór.
Déan an datha a dhíbirt agus a shábháil tar éis an rith

RABHADH: Tá ceimiceáin a d’fhéadfadh a bheith guaiseach sa tacar imoibrithe seo. Caith trealamh cosanta imleor agus caith amach imoibrithe a úsáidtear i gcomhréir leis na caighdeáin is infheidhme. Le haghaidh tuilleadh faisnéise, féach ar Threoir an Chórais Illumina NextSeq 1000 agus 2000 (doiciméad #1000000109376).

1. Nuair a bheidh an rith críochnaithe, roghnaigh Eject Cartridge.
   NÓTA: Is féidir an datha a úsáidtear lena n-áirítear sreabhchill a fhágáil i bhfeidhm go dtí an chéad rith eile, ach ní faide ná 3 lá.
2. Bain an datha as an tráidire.
3. Déan na himoibrithe a dhiúscairt i gcomhréir leis na caighdeáin is infheidhme.
4. Roghnaigh Dún an Doras. Tá an tráidire athluchtaithe.
5. Roghnaigh Baile chun filleadh ar an scáileán Baile.
   NÓTA: Ós rud é go bhfuil na meicníochtaí go léir sa datha chun an córas a rith, chomh maith le taiscumar chun imoibrithe a úsáidtear a bhailiú, ní gá nigh ionstraim tar éis an reáchtáil.

Stair athbhreithnithe

Leagan	Dáta	Cur síos
1.1	2022-11-01	1.2 Cuireadh Olink® NPX Explore in ionad Olink® Mydata. 2.2 Curtha in eagar.
1.0	2021-12-01	Nua

www.olink.com
Chun Úsáid Taighde Amháin. Gan Úsáid i Nósanna Imeachta Diagnóiseacha.
Áiríonn an táirge seo ceadúnas le haghaidh úsáid neamhthráchtála táirgí Olink. Féadfaidh ceadúnais bhreise a bheith ag teastáil ó úsáideoirí tráchtála. Téigh i dteagmháil le Olink Proteomics AB le haghaidh sonraí. Níl aon bharántas, sainráite nó intuigthe, a théann thar an tuairisc seo. Níl Olink Proteomics AB faoi dhliteanas i leith damáiste maoine, díobhála pearsanta, nó caillteanas eacnamaíoch de bharr an táirge seo.

Is le Olink Proteomics AB an trádmharc seo a leanas: Olink®.
Tá an táirge seo clúdaithe ag roinnt paitinní agus iarratais ar phaitinn atá ar fáil ag https://www.olink.com/patents/.

© Cóipcheart 2021 Olink Proteomics AB. Is maoin dá n-úinéirí faoi seach gach trádmharc tríú páirtí. Próitéamaíocht Olink, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, An tSualainn 1193, v1.1, 2022-11-01

Doiciméid / Acmhainní

Olink NextSeq 2000 Déan iniúchadh ar Seicheamh [pdfLámhleabhar Úsáideora NextSeq 2000 Iniúchadh Seicheamh, NextSeq 2000, Fiosraigh Seicheamh, Seicheamh

Tagairtí

• Lámhleabhar Úsáideora